Университет готовит магистрантов по 12 направлениям: биологические науки, техника и технологии строительства, промышленная экология и биотехнологии, техносферная безопасность и природообустройство, техника и технологии наземного транспорта, управление в технических системах, сельское, лесное и рыбное хозяйство, ветеринария и зоотехния, экономика и управление, юриспруденция, сервис и туризм, образование и педагогические науки.
Срок действия государственной аккредитации образовательных программ — до 2024 года.
