В деревянном здании 1916 года основания на улице Фрунзе открыли приют для мигрантов, как сообщают «Вести Новосибирск», с постояльцев брали плату за аренду, но совершенно не заботились об их безопасности, в здании не соблюдались правила пожарной безопасности. Кроме того, на территории появилось несколько пристроек.
Отмечается, мечетью владела мусульманская община «Илхас», мусульмане получили право пользования в 2007 году. В 2010 году здание было реставрировано, работы обошлись областному бюджету в 14 млн рублей.
В 2022 году после выявленных нарушений в ходе эксплуатации здания, департамент земельных и имущественных отношений региона расторг договор о безвозмездном пользовании с мусульманской общиной. Сейчас мечеть находится в оперативном управлении областной инспекции по охране памятников. Об этом VN.ru сообщила начальник ведомства Елена Медведева.
